Η λειτουργία του Συλλόγου Ποντίων Μονάχου ελέγχεται και ρυθμίζεται από επταμελές Διοικητικό Συμβούλιο (Δ.Σ.), το οποίο εκλέγεται κάθε δύο χρόνια, σύμφωνα με το Καταστατικό του Συλλόγου.
Η σύνθεση του Δ.Σ., όπως αυτό προέκυψε από τις τελευταίες εκλογές της 18ης Οκτωβρίου 2026, ορίζεται ως εξής:
- Πρόεδρος: Ιωάννα Χατζηελευθεριάδου
- Αντιπρόεδρος: Μιχάλης Αλεξανίδης
- Ταμίας: Αλεξάνδρα Μικελίδου
- Γραμματέας Α: Αναστασία Αναστασιάδου
- Γραμματέας Β: Μαρκέλλα Γινάτη
- Υπεύθυνη Νεολαίας & Καλλιτεχνικού: Παρθένα (Φένια) Τσακμακίδου
- Υπεύθυνος Δημοσίων Σχέσεων: Αναστάσιος Σαρράκης